Motorizētus atpūtas kuģus ar garumu līdz 12 metriem var reģistrēt Ceļu Satiksmes Drošības direkcijā (CSDD). CSDD reģistrētus atpūtas kuģus nav atļauts izmantot ārpus Latvijas Republikas teritorijas.
Buru atpūtas kuģus reģistrē Latvijas Jūras administrācijas Kuģu reģistrā.
Atpūtas kuģus, kurus izmanto komercdarbībai, reģistrē Latvijas Jūras administrācijas Kuģu reģistrā. CSDD reģistrētus atpūtas kuģus nav atļauts izmantot komercdarbībai.
Atpūtas kuģiem pirms reģistrācijas Latvijas Jūras administrācijas Kuģu reģistrā ir jāveic pirms reģistrācijas apskate, kuru veic Latvijas Jūras administrācijas Kuģošanas Drošības inspekcija. Apskates ir maksas pakalpojums
Pašbūvētos atpūtas kuģus nedrīkst izmantot komercdarbībai. Lai pašbūvētu atpūtas kuģi varētu izmantot komercdarbībai, ir jāveic atpūtas kuģa pēcbūves izvērtējums un nepieciešamības gadījumā jāveic atpūtas kuģa pārbūve. Tas ir dārgs un laikietilpīgs pasākums, tādēļ ir ieteicams komercdarbībai izmantot rūpnieciski būvētus atpūtas kuģus, kuri atbilst Ministru kabineta 2016. gada 12. janvāra noteikumiem Nr. 27 “Noteikumi par atpūtas kuģu un ūdens motociklu būvniecību, atbilstības novērtēšanu un piedāvāšanu tirgū”.
Atpūtas kuģiem, kurus izmanto komercdarbībai, ir jāveic periodiskas pārbaudes reizi divos gados. Šīs apskates veic Latvijas Jūras administrācijas Kuģošanas Drošības inspekcija. Apskates ir maksas pakalpojums.
Visus A kategorijas atpūtas kuģus un tos B kategorijas atpūtas kuģus, kurus izmanto komercdarbībā, aprīko ar radioboju, kuru reģistrē Latvijas Jūras administrācijas Kuģošanas Drošības inspekcijā. Radiobojas reģistrācija ir maksas pakalpojums.