Izņēmumus un atbrīvojumus no atsevišķu prasību izpildes Latvijas karoga kuģim var piešķirt tikai Latvijas Jūras administrācijas Kuģošanas Drošības inspekcija.
Katrs gadījums tiek izskatīts individuāli, primāri vērtējot kuģošanas drošības un vides aizsardzības adekvātu nodrošināšanu.
Vispārējā gadījumā kuģa īpašnieks vai kuģošanas sabiedrība vispirms vēršas pie atzītās organizācijas, lai izvērtētu potenciālā izņēmuma likumību, iespējamos kuģa ekspluatācijas ierobežojumus un iespējamo izņēmuma termiņu. Pēc atzītās organizācijas pozitīva atzinuma saņemšanas īpašnieks vēršas Kuģošanas Drošības inspekcijā, izklāstot apstākļus izņēmuma vai atbrīvojuma saņemšanai, kā arī pievieno atzītās organizācijas slēdzienu. Kuģošanas Drošības inspekcija pieņem lēmumu un nosacījumus izņēmuma vai atbrīvojuma piešķiršanai vai noraidīšanai.
Izņēmuma apliecību izsniedz vai nu Kuģošanas Drošības inspekcija, vai atzītā organizācija pēc Kuģošanas Drošības inspekcijas pilnvarojuma. Atsevišķos gadījumos Kuģošanas Drošības inspekcija var pieprasīt ierobežot saistītā konvenciālā vai nacionālā sertifikāta derīguma termiņu līdz izņēmuma apliecības derīguma termiņam.
