Izņēmumus un atbrīvojumus no atsevišķu prasību izpildes Latvijas karoga kuģim var piešķirt tikai Latvijas Jūras administrācijas Kuģošanas Drošības inspekcija.
Ja kuģis atrodas atzītās organizācijas tehniskajā uzraudzībā, tad vispārējā gadījumā kuģa īpašnieks vai kuģošanas sabiedrība vispirms vēršas pie atzītās organizācijas, lai izvērtētu potenciālā izņēmuma likumību, iespējamos kuģa ekspluatācijas ierobežojumus un iespējamo izņēmuma derīguma termiņu. Pēc atzītās organizācijas pozitīva atzinuma saņemšanas īpašnieks vēršas Kuģošanas Drošības inspekcijā, izklāstot apstākļus izņēmuma vai atbrīvojuma saņemšanai, kā arī pievieno atzītās organizācijas slēdzienu.
Ja kuģis atrodas Kuģošanas Drošības inspekcijas tehniskajā uzraudzībā, tad īpašnieks vēršas Kuģošanas Drošības inspekcijā, izklāstot apstākļus izņēmuma vai atbrīvojuma saņemšana.
Kuģošanas Drošības inspekcija pieņem lēmumu un nosacījumus izņēmuma vai atbrīvojuma piešķiršanai vai noraidīšanai. Katrs gadījums tiek izskatīts individuāli, primāri vērtējot kuģošanas drošības un vides aizsardzības adekvātu nodrošināšanu.
Izņēmuma apliecību izsniedz vai nu Kuģošanas Drošības inspekcija, vai atzītā organizācija pēc Kuģošanas Drošības inspekcijas pilnvarojuma. Atsevišķos gadījumos Kuģošanas Drošības inspekcija var pieprasīt ierobežot saistītā konvenciālā sertifikāta derīguma termiņu līdz izņēmuma apliecības derīguma termiņam.
